Entre las líneas estratégicas 2010-2014 de FIA está el objetivo de incrementar significativamente el número de empresas que innova en las regiones; acelerar la difusión tecnológica y apoyar a los gobiernos regionales en la promoción de la innovación y en la asignación de recursos destinados al desarrollo agrícola y forestal.

Es por ello que en 2010, la Fundación impulsó un acercamiento con las Secretarías Regionales Ministeriales de Agricultura y sus Comités de Innovación, propiciando la generación de redes entre los participantes de proyectos de innovación.

Junto con ello, desde 2009, FIA administra recursos provenientes de los Fondos de Innovación para la Competitividad Regionales, para lo cual mantuvo convenios vigentes en el 2009 con Antofagasta, Arica, Araucanía, Coquimbo, Maule, Magallanes y Valparaíso. En el 2010 con Antofagasta, Arica, Atacama, Maule y O’Higgins. Durante el 2011 se ha tramitado nuevos convenios con las regiones Metropolitana, Antofagasta, Araucanía, Los Ríos, O´Higgins y Magallanes.

En ese contexto, la Fundación administra una cartera de 21 iniciativas en ejecución, 11 iniciada en el año 2009 y 10 en el 2010.