Los representantes regionales son los embajadores de FIA en el territorio; deben coordinar y dar seguimiento a las distintas iniciativas y convocatorias de la institución, promoviéndolas y participando directamente en su desarrollo. Son los encargados de canalizar los distintos requerimientos específicos de innovación agraria, desde sus territorios; y son un participante activo en las instancias de articulación y coordinación a nivel sectorial y de innovación en las regiones.